TABLE 1.

List of primers used to introduce envelope modifications

PrimerSequencea
A5′-GAGCCAGTAGATCCTAGATTAGAG-3′
B5′-AGCTGTGTTGAATTACAGTAG-3′
C5′-ACAATTTCCAGCTCCAACACAGAGTGGGGT-3′
D5′-TGTGTTGGAGCTGGAAATTGTAACACCTCA-3′
E5′-GGGGTACCTGTGTGGAAAGACGCAGAG ACC-3′
F5′-GCTGTCAGTGCTATTTCCCCCCCATGTGC-3′
G5′-TAATCTGCCGGCGCCGGTCATATTGTAAG-3′
H5′-ATGACCGGCGCCGGCAGATTAATAATTG-3′
I5′-GGGGCATCATGCTCCTTGGGATGTTGC-3′
J5′-CCCCTCCTCAATTAAAACTCTGCATTAC-3′
K5′-CAACCTTCCAGCTCCGATATTGAAAGAGCA-3′
L5′-AATATCGGAGCTGGAAGGTTGATAAATTGT-3′
gp160F5′-GGACCATAGTGTACATAGAATACAG-3′
env9R5′-GGTCTTAAAGGTACCTGAGGTCTG-3′
ΔV3F5′-CAATAATGGAGCTGGAGATATAAGACAAGCAC-3′
ΔV3R5′-TATATCTCCAGCTCCATTATTGTTAGGTCTTG-3′
BamF5′-CCAGTCCATTAGTGCATGGATCCTTAGCACTCATCTGGGACG-3′
BamR5′-CGTCCCAGATGAGTGCTAAGGATCCATGCACTAATG GACTG-3′
SF162F5′-GAATTCTGCAACAACTGCTG-3′
ΔV3cF5′-GCATTTTATGCAACAGGAGCTGGACATTGTAACATTAGTGG-3′
ΔV3cR5′-CCACTAATGTTACAATGTCCAGCTCCTGTTGCATAAAATGC-3′
Nhe162F5′-GGGATGTTGATGATCTGTGCTAGCGTAGAAAAATTGTGGGTC-3′
Nhe162R5′-GTGACCCACAATTTTTCTACGCTAGCACAGATCATCAACATC-3′
Cla160F5′-GGGCTTTGCTATAACATCGATGGCAAGTGGTC-3′
Cla160R5′-GACCACTTGCCATCGATGTTATAGCAAAGCCC-3′
gp160R5′-TCAGCTGGCTCAGCTCGTTTCATTC-3′
D162NF5′-GAGGATATAATCAGTTTATGGAATCAAAGTCTAAAGCC-3′
D162NR5′-GGCTTTAGACTTTGATTCCATAAACTGATTATATCCTC-3′
  • a Nucleotides in bold represent insertions of the GAG tripeptide.